吉林农业科技学院实验检测中心于2006年建立，是学校教学、科研和人才培养的公共平台，同时面向社会开展检测服务。2011年学校依托实验检测中心成立的长白山动植物资源利用与保护实验室被教育厅确认为省级重点建设实验室，并于2017年12月通过教育厅专家组评审验收，正式成为“省级重点实验室”；2014年依托实验检测中心成立了农产品检测中心，并在同年12月份农产品检测中心获得了省质监局（原）食品检测机构资质认证（CMA），2017年10月和2023年7月分别顺利通过了吉林省市场监督管理厅复查评审。2024年12月获得农产品质量安全机构考核CATL资质证书，成为吉林市首个省级CMA、CATL双认证的高校检测机构。

中心现有工作人员21人，其中高级职称16人，占比76.2%，具有博士学位人员12人，占比57.1%。现有液相色谱质谱联用仪、气相色谱质谱联用仪、液相-原子荧光联用仪等专业检测设备79台套，固定资产原值1500余万元。建有液相色谱室、气相色谱室、元素分析室等8个专业的实验室，建筑面积2549㎡。承担全校食品检测与安全、药物分析、生物应用技术等12个专业的分析类课程实验、实训教学任务，年均接待大学生创新项目、毕业论文等30余项。中心已经举办了三期大型精密仪器培训班，现已结业60余人。 中心将继续秉承服务教学、服务科研、服务社会的理念，以检测能力培养为中心，以社会需求为导向，培养具有大型精密仪器检测能力高素质应用型人才。